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No Mendeley Desktop em Tools > Options, selecione o separador BibTeX e active a opção:
Poderá sincronizar toda a library usando a opção Create one BibTex file for my whole library.
Ao clicar OK será criado um ficheiro com a extensão .bib, que será sincronizado automaticamente com a library do Mendeley e que usar com o LaTeX.
No blog oficial do Mendeley poderá consultar o guia como articular o Mendeley com o LaTeX e BibTeX.
Com o EndNote pode igualmente exportar as referências para serem usadas pelo LaTeX. Para isso deverá:
Notas: Esta exportação poderá apresentar erros.
Antes de efetuar a exportação deverá editar cada referência no EndNote e colocar no campo Label um número identificador único.
Para quem usa o Latex, e tem um grande número de referências, recomenda-se o uso do Mendeley.
Poderá enccontrar informação mais detalhada em www.rhizobia.co.nz/latex/convert.